6.0 Finde Ra's al Ghul und besorge von ihm eine Blutprobe I
6.1 Scanne das Blut der Assassine, um eine forensische Spur zu erzeugen und ihr zu folgen.
Ihr müsst jetzt der Spur der entflohenen Assassine folgen. Aktiviert dazu den Detektiv-Modus, visiert die Blutlache der Assassine an und scannt sie. Verlasst das Museum und wechselt in den Detektiv-Modus. Die Assassine hat eine Spur hinterlassen, der ihr jetzt folgen müsst. Sie erstreckt sich vom Museum aus nach Norden und macht dabei einen Bogen zu The Bowery. Die Spur endet genau auf dem Gebäudes rechts neben dem Gebäude, auf dem sich vorhin der zweite Störsender des Pinguins befand. Südlich von Park Row und östlich vom ACE Chemicals-Gebäude. Hier findet ihr die Verbände der Assassine, die ihr erneut scannen müsst.
6.2 Finde die Assassine und bringe den Ortungssender an
Nachdem ihr den Verband gescannt habt, werdet ihr von der Assassine angegriffen. Verfolgt sie über die Dächer, bis sie euch angreift. Ihr braucht nur einmal zu kontern, um den Sender unbemerkt anzubringen. Es folgt eine Zwischensequenz, in der Robin das erste Mal auftaucht.
6.3 Benutze den Ortungssender, um der Assassine zu folgen und Ra's al Ghul aufzuspüren
Ihr müsst jetzt der Assassine anhand des Ortungssenders folgen. Die noch zurückzulegende Entfernung wird euch in der Bildschirmmitte angezeigt. Ihr werdet zu einem großen Loch geführt, dem U-Bahn-Wartungszugang. Dort angekommen lauft ihr Richtung Norden und dann die erste Abbiegung nach links, hier trefft ihr auf drei Feinde, derer ihr euch entledigt. Geht weiter Richtung Westen, dann an der nächsten Abbiegung nach rechts und slidet unter dem Tor durch.
Hier kommt jetzt euer neuer Seilwerfer zum Einsatz. Zielt auf die gegenüberliegende Seite und „fahrt“ los. Sobald ihr nahe der Kreuzung seid, haltet L1/LB gedrückt und schießt mit R1/RB in den linken Gang, im Westen. So lenkt ihr eure Seilfahrten um. Lauft dann den Gang Richtung Süden runter. Und dann nach Westen in Richtung der U-Bahn-Haltestelle. Hier warten mitunter bewaffnete Gegner auf euch, den ersten könnt ihr allerding sofort erledigen, indem ihr euch im Detektiv-Modus auf den Holzboden so postiert, dass ihr ihn mit Dreieck/Y direkt ausschalten könnt.
Erledigt sie alle. Links von den beiden geschlossenen Zug-Toren im Westen befindet sich link an der Wand ein Eingabe-Pad, dass ihr knacken müsst. Danach öffnen sich die Tore und ihr lauft Richtung Norden und durch die Tür, durch die ihr in den auf der Karte verzeichneten Gang gelangt. Geht den bis ans Ende, zieht euch mit dem Seilwerfer auf die andere Seite des Loches und dann mit der Batclaw eine Ebene höher. Geht durch die Tür. Euch wird kurzzeitig schwindelig. Haltet euch links und überbrückt mit eurem Seilwerfer die Distanz zur anderen Seite im Westen.
Die Feinde rechts von euch werden euch nicht bemerken. Drüben angekommen kümmert ihr euch um die Feinde. Vorsicht, 2 davon sind bewaffnet. Nehmt danach die Tür im Norden. Hier müsst ihr jetzt die Ärztin Fiona Wilson befreien, allerdings hat einer der 6 bewaffneten Feinde einen Störsender, den es also zuerst auszuschalten gilt, damit ihr euren Detektiv-Modus benutzen könnt.
Erledigt ihn von einem der inneren Aussichtspunkte, wenn er sich weitestgehend von der Gruppe entfernt hat. Passt aber auf, die Wachen zerstören jetzt auch mit ihren Maschinengewehren Aussichtspunkte. Den letzten müsst ihr wieder hinterrücks erledigen, da er wieder die Geisel als Schutzschild benutzt. Erledigt die Feinde und befreit Fiona. Benutzt die Tür im Norden, ihr gelangt durch sie in der Wonder Avenue. Ihr werdet benommen und spuckt Blut. Vor dem Tor im Norden befindet sich im Boden ein Generator, den ihr mit eurem DSL mit einer positiven Ladung beschießen müsst. Dasselbe Spiel auch am Tor im nächsten Raum.
Hier warten 3 bewaffnete Assassinen auf euch, die ihr erledigen müsst. Das nächste Tor lässt sich auch mithilfe des Generators öffnen, nur dass ihr diesen vorher mit einer Ladung Explosivgel freilegen müsst. Im nächsten Raum zieht ihr euch gleich rechts auf die Erhöhung und geht in den Raum, damit schaltet ihr die Trophäe "Fundbüro" frei. Lauft zum Tor im Norden, es folgt eine Cutscene.
